In 1989 werd voor Nederland een eerste Rode lijst van (met uitsterven) bedreigde soorten vastgesteld, waarin bijna eenderde van alle inheemse soorten werd opgenomen. Van soorten, waarbij in de tekst alleen Rode Lijst (zonder kwalificatie) staat vermeld, is inmiddels gebleken, dat zij niet langer als gevoelig, kwetsbaar of bedreigd hoeven te worden beschouwd. Zij werden dan ook niet meer in de nieuwe Rode Lijst opgenomen.
In 1996 werd in de Staatscourant een nieuwe officiële Rode Lijst gepubliceerd, met daarop 1655 soorten (67%) van de 2475 soorten, waarvan voldoende gegevens bekend waren om ze voor eventuele opname in de Rode Lijst in aanmerking te laten komen.
Vervolgens werd in 2008 het Basisrapport Rode Lijst uitgebracht, met daarop 1.619 soorten (62%) van de 2.624 soorten, waarvan voldoende gegevens bekend waren om ze voor eventuele opname in de Rode Lijst in aanmerking te laten komen.
De Rode Lijst kent de volgende, op de desbetreffende soortkaarten bij status van voorkomen aangegeven categorieën :

RL(GE) : Gevoelig
RL(KW) : Kwetsbaar
RL(BE) : Bedreigd
RL(EB) : Ernstig bedreigd
RL(VU) : Uit Nederland verdwenen (na 1975 niet waargenomen)